Владимир Николаевич Воробьев родился 28 марта 1941 г. в Москве. Дед — тоже протоиерей Владимир Воробьев — был благочинным, настоятелем московского храма святителя Николая в Плотниках на Арбате.
Отец Владимир поступил в 1959 г. на физический факультет Московского государственного университета, который и окончил в 1965 г. Работал в МГУ, затем с 1966 г. учился в аспирантуре и с 1970 г. работал в Вычислительном Центре Академии Наук СССР.
В 1973 г. защитил диссертацию и получил ученую степень кандидата физико-математических наук.
В 1977 г. поступил в Московскую духовную семинарию, которую окончил в 1980 г. В 1982 г. закончил Московскую духовную академию.
18 марта 1979 г. был рукоположен во диакона, 30 апреля во священника.
Служил в храме Казанской иконы Божией Матери в Коломенском, затем в Никольской церкви у Преображенского кладбища. В 1984 г. переведен в Успенский храм в Вешняках, в 1990 г. — в храм святителя Николая Чудотворца в Кузнецах, в 1997 г. назначен настоятелем Николо-Кузнецкой церкви и приписного к ней храма Живоначальной Троицы в Вешняках, который был открыт и восстановлен под руководством о. Владимира.
В октябре 1990 г. о. Владимир участвовал в создании Братства во имя Всемилостивого Спаса, со временем превратившегося в одно из крупнейших братств в России (в 1994 году опекало 14 храмов, из которых 13 восстанавливались). Стал духовником Братства. Под руководством о. Владимира были созданы православная общеобразовательная и воскресная школы, детские лагеря, столовая для бедных, книжный магазин «Православное слово».
В 1990 г. стал одним из организаторов Богословско-катехизаторских курсов, в мае 1991 г. был избран ректором курсов, затем, после преобразования курсов в Богословский институт в 1992 г., — ректором Православного Свято-Тихоновского богословского института. В мае 2004 институт получил статус университета и был преобразован в ПСТГУ.
В университете читает лекции по предметам «Введение в литургическое предание Православной Церкви» и «Пастырское богословие». Под руководством о. Владимир в ПСТБИ был разработан государственный образовательный поликонфессиональный стандарт по теологии, ставший основой для открытия специальности «Теология» в государственном классификаторе и создания теологических факультетов и отделений в государственных вузах.
О. Владимир является одним из организаторов изучения истории Русской Церкви в XX в. и прославления новомучеников Российских. Возглавляет в ПСТГУ Отдел новейшей истории Русской Православной Церкви, который проводит большую работу по сбору материалов о гонениях на Православную Церковь в России в 20-40-х гг. XX в. и издает научную серию «Материалы по новейшей истории РПЦ» (с 1994). В 1998 г. о. Владимир вошел в Синодальную комиссию по канонизации святых, активно участвовал в подготовке масштабной канонизации новомучеников и исповедников Российских на Архиерейском юбилейном Соборе Русской Православной Церкви 2000 г.
О. Владимир является заместителем председателя Учебного комитета при Священном Синоде по вопросам лицензирования, аккредитации и стандартам (с 2002 года), членом Синодальной богословской комиссии, Издательского Совета МП, научно-редакционного совета по изданию «Православной энциклопедии», членом редколлегии журнала «Православная беседа» и других церковных и светских научно-образовательных объединений и организаций. Является сопредседателем Учебно-методического объединения по классическому университетскому образованию по теологии Министерства Образования РФ.