Андрей Комиссаров
Штаммы коронавируса в мире
Заведующий лабораторией молекулярной вирусологии НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева Андрей Комиссаров о вариантах коронавируса, циркулирующих в России и мире.
Основные штаммы, которые вызывают обеспокоенность в настоящее время:
— Alfa, британский штамм — B.1.1.7;
— Beta, южноафриканский штамм — B.1.351;
— Gamma, бразильский штамм — P1;
— Delta, индийский штамм — B.1.617.2.
Штаммы COVID-19 в России
В России циркулируют вирусы SARS-CoV-2, принадлежащие к различным генетическим линиям. Всего выявлены представители 139 из 1296 линий (штаммов) по классификации PANGO — самой дробной из известных систематизаций штаммов.
Не для всех регионов есть достаточные объемы данных. По ряду регионов есть большой объем данных, но для большего числа регионов данные фрагментарные. Наиболее охвачены генетическими исследованиями Санкт-Петербург, Москва, Екатеринбург, Свердловская область (в 2020 году также Омская область).
Британский штамм B.1.1.7 циркулирует в России с начала 2021 года. Его доля росла, однако с появлением индийского штамма, рост как минимум прекратился, и можно предположить, что доля этого штамма будет снижаться. И то, что мы видим по данным Великобритании, показывает, что конкурентную борьбу с индийском штаммом британский проигрывает.
Линия АТ.1 (B.1.1.370.1) — северо-западный вариант коронавируса. Это линия, эндемичная для России. Возникла на северо-западе страны, первые образцы выявили в январе-феврале 2021 года в Псковской области и Санкт-Петербурге.
Интересная своеобразным, нетипичным, уникальным набором замен. Особый интерес представляют замены в спайк-белке. Такого не встречается ни в каких других коронавирусах.
Он распространен на данный момент в Санкт-Петербурге, Ленинградской, Псковской, Новгородской областях, Москве и Белгородской области.
Случаи заражения этим штаммом зарегистрированы также в Финляндии, Германии, Великобритании, США и Израиле.
По данным ПЦР-скрининга, около 16% госпитализированных пациентов в КИБ им.Боткина в мае этого года были заражены именно этим штаммом.
С появлением индийского штамма доля AT.1 начала снижаться, но пока не упала до нуля.
Линия B.1.1.523. Количество штаммов этой линии медленно, но нарастает. В основном он распространен в Москве, Центральном Федеральном округе, также отдельные образцы выявили в Санкт-Петербурге, Свердловской области и Ставропольском крае.
Частота южноафриканского штамма B.1.351 в России очень низкая.
Как меняется ситуация в 2021 году
В начале 2021 года основными в России были родительская линия B.1.1 и дочерние, эндемичные для России, B1.1.317, B.1.1.397, и в очень небольших количествах наблюдался британский штамм B.1.1.7.
Дальше ситуация менялась. Эндемичные российские линии сходили на нет, количество британского штамма постепенно увеличивалось.
Возникла новая российская эндемичная линия AT.1 (северо-западный штамм), получившая также распространение и в других странах.
Начиная со второй половины апреля, после первых случаев завоза индийского штамма B.1.617.2 в Россию, начало увеличиваться число выявляемых случаев заражения именно этим штаммом.
Индийский штамм в России
Индийский штамм зарегистрирован в 63 странах. Он характеризуется важными заменами в спайк-белке.
Сейчас происходит очень быстрое увеличение доли этого вируса, и эта ситуация характерна не только для отдельных регионов нашей страны, но также и для Великобритании, например, где этот штамм очень активно вытесняет британский штамм.
Это штамм, вызывающий наибольшую обеспокоенность как глобально, так и в частности, в масштабах России, где в ряде регионов он очень быстро вытесняет другие.
Эффективность «Спутник V» против новых штаммов
Вакцина «Спутник V» эффективна против всех основных вариантов, вызывающих опасение: британского, южноафриканского, бразильского, индийского штамма и доминирующих локальных линий, заявил во время семинара руководитель лаборатории механизмов популяционной изменчивости патогенных микроорганизмов ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России Владимир Гущин.
Вируснейтрализующее свойство может снижаться для различных штаммов, что может приводить к небольшому повышению заражений с легким течением болезни, но при этом нельзя говорить о серьезном снижении или полном отсутствии эффективности вакцины.
Риск перенести заболевание в среднетяжелой и тяжелой форме у получивших две дозы вакцины «Спутник V» в случае заболевания в 14 раз ниже, чем у невакцинированных.